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<VirtualHost *:80>
    ServerName seudominio.com.br
    ServerAlias *.seudominio.com.br
    DocumentRoot /var/www/seudominio.com.br
    # Demais diretrizes...
</VirtualHost>

<?PHP
$subdomains = str_replace('.seudominio.com.br','',$_SERVER['HTTP_HOST']);
$subdomains = explode('.',$subdomains);
var_dump($subdomains);