pd.concat したときに Index の情報が消えていないデータフレームと消えたデータフレームを concat するので生じる np.nan が現れるスクリプト
import numpy as np
import pandas as pd
d = pd.DataFrame([[i, i+1, i+2] for i in range(10)], columns=['A', 'B', 'C'])
even = d[d.A % 2 == 0]
print(pd.concat([even.A, pd.DataFrame(np.array(even[['B', 'C']]))], axis=1))