Fetch ucsc tools and stash in homebrew directory.
get_ucsc_tool addCols
get_ucsc_tool ameme
get_ucsc_tool autoDtd
get_ucsc_tool autoSql
get_ucsc_tool autoXml
get_ucsc_tool ave
get_ucsc_tool aveCols
get_ucsc_tool axtChain
get_ucsc_tool axtSort
get_ucsc_tool axtSwap
get_ucsc_tool axtToMaf
get_ucsc_tool axtToPsl
get_ucsc_tool bedClip
get_ucsc_tool bedCommonRegions
get_ucsc_tool bedCoverage
get_ucsc_tool bedExtendRanges
get_ucsc_tool bedGeneParts
get_ucsc_tool bedGraphPack
get_ucsc_tool bedGraphToBigWig
get_ucsc_tool bedIntersect
get_ucsc_tool bedItemOverlapCount
get_ucsc_tool bedPileUps
get_ucsc_tool bedRemoveOverlap
get_ucsc_tool bedRestrictToPositions
get_ucsc_tool bedSort
get_ucsc_tool bedToBigBed
get_ucsc_tool bedToExons
get_ucsc_tool bedToGenePred
get_ucsc_tool bedToPsl
get_ucsc_tool bedWeedOverlapping
get_ucsc_tool bigBedInfo
get_ucsc_tool bigBedNamedItems
get_ucsc_tool bigBedSummary
get_ucsc_tool bigBedToBed
get_ucsc_tool bigPslToPsl
get_ucsc_tool bigWigAverageOverBed
get_ucsc_tool bigWigCat
get_ucsc_tool bigWigCluster
get_ucsc_tool bigWigCorrelate
get_ucsc_tool bigWigInfo
get_ucsc_tool bigWigMerge
get_ucsc_tool bigWigSummary
get_ucsc_tool bigWigToBedGraph
get_ucsc_tool bigWigToWig
get_ucsc_tool blastToPsl
get_ucsc_tool blastXmlToPsl
get_ucsc_tool blat
get_ucsc_tool calc
get_ucsc_tool catDir
get_ucsc_tool catUncomment
get_ucsc_tool chainAntiRepeat
get_ucsc_tool chainFilter
get_ucsc_tool chainMergeSort
get_ucsc_tool chainNet
get_ucsc_tool chainPreNet
get_ucsc_tool chainSort
get_ucsc_tool chainSplit
get_ucsc_tool chainStitchId
get_ucsc_tool chainSwap
get_ucsc_tool chainToAxt
get_ucsc_tool chainToPsl
get_ucsc_tool chainToPslBasic
get_ucsc_tool checkAgpAndFa
get_ucsc_tool checkCoverageGaps
get_ucsc_tool checkHgFindSpec
get_ucsc_tool checkTableCoords
get_ucsc_tool chopFaLines
get_ucsc_tool chromGraphFromBin
get_ucsc_tool chromGraphToBin
get_ucsc_tool colTransform
get_ucsc_tool countChars
get_ucsc_tool crTreeIndexBed
get_ucsc_tool crTreeSearchBed
get_ucsc_tool dbSnoop
get_ucsc_tool dbTrash
get_ucsc_tool estOrient
get_ucsc_tool faAlign
get_ucsc_tool faCmp
get_ucsc_tool faCount
get_ucsc_tool faFilter
get_ucsc_tool faFilterN
get_ucsc_tool faFrag
get_ucsc_tool faNoise
get_ucsc_tool faOneRecord
get_ucsc_tool faPolyASizes
get_ucsc_tool faRandomize
get_ucsc_tool faRc
get_ucsc_tool faSize
get_ucsc_tool faSomeRecords
get_ucsc_tool faSplit
get_ucsc_tool faToFastq
get_ucsc_tool faToTab
get_ucsc_tool faToTwoBit
get_ucsc_tool faTrans
get_ucsc_tool fastqToFa
get_ucsc_tool featureBits
get_ucsc_tool fetchChromSizes
get_ucsc_tool findMotif
get_ucsc_tool gapToLift
get_ucsc_tool genePredCheck
get_ucsc_tool genePredFilter
get_ucsc_tool genePredHisto
get_ucsc_tool genePredSingleCover
get_ucsc_tool genePredToBed
get_ucsc_tool genePredToBigGenePred
get_ucsc_tool genePredToFakePsl
get_ucsc_tool genePredToGtf
get_ucsc_tool genePredToMafFrames
get_ucsc_tool getRna
get_ucsc_tool getRnaPred
get_ucsc_tool gff3ToGenePred
get_ucsc_tool gff3ToPsl
get_ucsc_tool gmtime
get_ucsc_tool gtfToGenePred
get_ucsc_tool headRest
get_ucsc_tool hgFindSpec
get_ucsc_tool hgGcPercent
get_ucsc_tool hgLoadBed
get_ucsc_tool hgLoadChain
get_ucsc_tool hgLoadMaf
get_ucsc_tool hgLoadMafSummary
get_ucsc_tool hgLoadNet
get_ucsc_tool hgLoadOut
get_ucsc_tool hgLoadOutJoined
get_ucsc_tool hgLoadWiggle
get_ucsc_tool hgSpeciesRna
get_ucsc_tool hgTrackDb
get_ucsc_tool hgWiggle
get_ucsc_tool hgsql
get_ucsc_tool hgsqldump
get_ucsc_tool htmlCheck
get_ucsc_tool hubCheck
get_ucsc_tool hubPublicCheck
get_ucsc_tool ixIxx
get_ucsc_tool lavToAxt
get_ucsc_tool lavToPsl
get_ucsc_tool ldHgGene
get_ucsc_tool liftOver
get_ucsc_tool liftOverMerge
get_ucsc_tool liftUp
get_ucsc_tool linesToRa
get_ucsc_tool localtime
get_ucsc_tool mafAddIRows
get_ucsc_tool mafAddQRows
get_ucsc_tool mafCoverage
get_ucsc_tool mafFetch
get_ucsc_tool mafFilter
get_ucsc_tool mafFrag
get_ucsc_tool mafFrags
get_ucsc_tool mafGene
get_ucsc_tool mafMeFirst
get_ucsc_tool mafOrder
get_ucsc_tool mafRanges
get_ucsc_tool mafSpeciesList
get_ucsc_tool mafSpeciesSubset
get_ucsc_tool mafSplit
get_ucsc_tool mafSplitPos
get_ucsc_tool mafToAxt
get_ucsc_tool mafToPsl
get_ucsc_tool mafToSnpBed
get_ucsc_tool mafsInRegion
get_ucsc_tool makeTableList
get_ucsc_tool maskOutFa
get_ucsc_tool mktime
get_ucsc_tool mrnaToGene
get_ucsc_tool netChainSubset
get_ucsc_tool netClass
get_ucsc_tool netFilter
get_ucsc_tool netSplit
get_ucsc_tool netSyntenic
get_ucsc_tool netToAxt
get_ucsc_tool netToBed
get_ucsc_tool newProg
get_ucsc_tool newPythonProg
get_ucsc_tool nibFrag
get_ucsc_tool nibSize
get_ucsc_tool oligoMatch
get_ucsc_tool overlapSelect
get_ucsc_tool paraFetch
get_ucsc_tool paraSync
get_ucsc_tool positionalTblCheck
get_ucsc_tool pslCDnaFilter
get_ucsc_tool pslCat
get_ucsc_tool pslCheck
get_ucsc_tool pslDropOverlap
get_ucsc_tool pslFilter
get_ucsc_tool pslHisto
get_ucsc_tool pslLiftSubrangeBlat
get_ucsc_tool pslMap
get_ucsc_tool pslMrnaCover
get_ucsc_tool pslPairs
get_ucsc_tool pslPartition
get_ucsc_tool pslPosTarget
get_ucsc_tool pslPretty
get_ucsc_tool pslRecalcMatch
get_ucsc_tool pslReps
get_ucsc_tool pslScore
get_ucsc_tool pslSelect
get_ucsc_tool pslSort
get_ucsc_tool pslStats
get_ucsc_tool pslSwap
get_ucsc_tool pslToBed
get_ucsc_tool pslToBigPsl
get_ucsc_tool pslToChain
get_ucsc_tool pslToPslx
get_ucsc_tool pslxToFa
get_ucsc_tool qaToQac
get_ucsc_tool qacAgpLift
get_ucsc_tool qacToQa
get_ucsc_tool qacToWig
get_ucsc_tool raSqlQuery
get_ucsc_tool raToLines
get_ucsc_tool raToTab
get_ucsc_tool randomLines
get_ucsc_tool rmFaDups
get_ucsc_tool rowsToCols
get_ucsc_tool sizeof
get_ucsc_tool spacedToTab
get_ucsc_tool splitFile
get_ucsc_tool splitFileByColumn
get_ucsc_tool sqlToXml
get_ucsc_tool stringify
get_ucsc_tool subChar
get_ucsc_tool subColumn
get_ucsc_tool tailLines
get_ucsc_tool tdbQuery
get_ucsc_tool textHistogram
get_ucsc_tool tickToDate
get_ucsc_tool toLower
get_ucsc_tool toUpper
get_ucsc_tool transMapPslToGenePred
get_ucsc_tool trfBig
get_ucsc_tool twoBitDup
get_ucsc_tool twoBitInfo
get_ucsc_tool twoBitMask
get_ucsc_tool twoBitToFa
get_ucsc_tool validateFiles
get_ucsc_tool validateManifest
get_ucsc_tool wigCorrelate
get_ucsc_tool wigEncode
get_ucsc_tool wigToBigWig
get_ucsc_tool wordLine
get_ucsc_tool xmlCat
get_ucsc_tool xmlToSql
function get_ucsc_tool() {
curl http://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/macOSX.x86_64/${1} > `brew --prefix`/bin/${1}
chmod +x `brew --prefix`/bin/${1}
}