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登録済みおのファイルは以下のコマンドを実行してからでないと設定が反映されない。
コマンドを実行してもローカルのファイルは消えない

git rm --cached hoge.tmp

.gitignoreに記載されたファイルにまとめて実行する場合は以下のコマンド

git rm --cached `git ls-files --full-name -i --exclude-from=.gitignore`